Das Projekt umfasst insgesamt mehrere Bauabschnitte. BPR Dr. Schäpertöns Consult wurde von der DB Netz AG beauftragt, die Ausführungsplanung für den ersten Bauabschnitt und die erste Inbetriebnahmestufe (Interimszustand) zu erstellen und die Inbetriebnahme abzusichern. Dieser Bauabschnitt umfasst den Neubau von S-Bahngleisen aus Wedding und Westhafen, die in einem unterirdischen Interimsbahnsteig unter dem Hauptbahnhof Berlin vorerst enden. Die Ausführungsplanung für den ersten Bauabschnitt gliedert sich in fünf Planpakete für die Gewerke Oberbau/Tiefbau/ Kabeltiefbau/Entwässerung. Die Inbetriebnahme des ersten Bauabschnittes mit dem Interimszustand ist für das Jahr 2021 vorgesehen.